Z dniem 1 listopada 2005 roku została wprowadzona nowa struktura organizacyjna Spółki. Z dniem 28.04.2006 zmieniona została struktura organizacyjna pionu Dyrektora NZOZ. Ogólny schemat organizacyjny Spółki oraz schemat organizacyjny pionu Dyrektora NZOZ przedstawiają załączniki.
(Podstawa prawna: Uchwała nr 9/I/2005 Zarządu Powiatowego Centrum Zdrowia Spółka z o.o. w Kowarach z dnia 13 października 2005 oraz Uchwała nr 4/I/2006 Zarządu Powiatowego Centrum Zdrowia Spółka z o.o. w Kowarach z dnia 28 kwietnia 2006)